view --main bgpt-paper-search-avtomatizirovannyy-poisk-i-izvlechenie-dannyh-iz-publikatsiy.md

bgpt-paper-search — Автоматизированный поиск и извлечение данных из публикаций

Name: bgpt-paper-search — Автоматизированный поиск и извлечение данных из публикаций
Author: K-Dense-AI/claude-scientific-skills

BGPT Paper Search решает проблему поиска и извлечения структурированных данных из научных публикаций, выходя за рамки традиционного поиска по абстрактам. Это open-source решение, позволяющее получить детальную информацию об экспериментах, включая количественные результаты, размеры выборок и оценки качества. Инструмент предназначен для автоматизации рутинных задач анализа научной литературы.

BGPT использует MCP (Metadata Command Protocol) и JavaScript для работы с удаленным сервером, исключая необходимость локальной установки. Функциональность включает поиск публикаций по конкретным экспериментальным деталям и извлечение более 25 метаданных по каждой работе, что особенно полезно при проведении систематических обзоров и мета-анализов. В основе лежит технология Claude для обработки текста.

BGPT Paper Search – это удобный инструмент разработчика для исследователей и специалистов в области биоинформатики и научных вычислений, обеспечивающий автоматизацию сбора и структурирования данных из научных публикаций. Он позволяет эффективно находить и сравнивать методологии, а также извлекать количественные данные, недоступные в традиционных базах данных.

$ git log --oneline --stat

⭐ звёзды: 16,600

форки: 1,813

обновлено: 25 марта 2026 года в 21:40

Проводник файлов

1 файлы

SKILL.md

readonly --- lines

--- name: bgpt-paper-search description: Search scientific papers and retrieve structured experimental data extracted from full-text studies via the BGPT MCP server. Returns 25+ fields per paper including methods, results, sample sizes, quality scores, and conclusions. Use for literature reviews, evidence synthesis, and finding experimental details not available in abstracts alone. allowed-tools: Bash license: MIT metadata: skill-author: BGPT website: https://bgpt.pro/mcp github: https://github.com/connerlambden/bgpt-mcp --- # BGPT Paper Search ## Overview BGPT is a remote MCP server that searches a curated database of scientific papers built from raw experimental data extracted from full-text studies. Unlike traditional literature databases that return titles and abstracts, BGPT returns structured data from the actual paper content — methods, quantitative results, sample sizes, quality assessments, and 25+ metadata fields per paper. ## When to Use This Skill Use this skill when: - Searching for scientific papers with specific experimental details - Conducting systematic or scoping literature reviews - Finding quantitative results, sample sizes, or effect sizes across studies - Comparing methodologies used in different studies - Looking for papers with quality scores or evidence grading - Needing structured data from full-text papers (not just abstracts) - Building evidence tables for meta-analyses or clinical guidelines ## Setup BGPT is a remote MCP server — no local installation required. ### Claude Desktop / Claude Code Add to your MCP configuration: ```json { "mcpServers": { "bgpt": { "command": "npx", "args": ["mcp-remote", "https://bgpt.pro/mcp/sse"] } } } ``` ### npm (alternative) ```bash npx bgpt-mcp ``` ## Usage Once configured, use the `search_papers` tool provided by the BGPT MCP server: ``` Search for papers about: "CRISPR gene editing efficiency in human cells" ``` The server returns structured results including: - **Title, authors, journal, year, DOI** - **Methods**: Experimental techniques, models, protocols - **Results**: Key findings with quantitative data - **Sample sizes**: Number of subjects/samples - **Quality scores**: Study quality assessments - **Conclusions**: Author conclusions and implications ## Pricing - **Free tier**: 50 searches per network, no API key required - **Paid**: $0.01 per result with an API key from [bgpt.pro/mcp](https://bgpt.pro/mcp) ## Complementary Skills Pairs well with: - `literature-review` — Use BGPT to gather structured data, then synthesize with literature-review workflows - `pubmed-database` — Use PubMed for broad searches, BGPT for deep experimental data - `biorxiv-database` — Combine preprint discovery with full-text data extraction - `citation-management` — Manage citations from BGPT search results

Инициализация мануала...